1969年建站前身：中国科学院林业土壤研究所昭乌达盟科研小分队

1975年正式建站：中国科学院林业土壤研究所乌兰敖都沙地造林试验站

1978年定名：中国科学院林业土壤研究所乌兰敖都试验站

1987年改名：中国科学院沈阳应用生态研究所乌兰敖都试验站

1996年更名：中国科学院沈阳应用生态研究所乌兰敖都荒漠化防治生态试验站

2025年申报建设：中国科学院科尔沁沙地生态系统野外科学观测研究站（院级站建设）