中国科学院林业土壤研究所成立。

研究所承担了中苏黑龙江流域自然资源综合考察等国家级大规模科考任务。

以《动态地植物学》等为代表的近十项研究成果荣获全国科学大会重大科技成果奖。

研究所明确提出“以包括森林生态、农田生态和污染生态三方面的陆地生态研究作为主攻方向，相应发展土壤微生物、东北土壤、东北植物和东北森林”的发展方向。

研究所更名为“中国科学院沈阳应用生态研究所”，确立了“应用生态”的发展方向。

为加强科技开发工作，从资源植物月见草油起步，逐步扩展到微生物资源、新型肥料，取得良好收效。

为争取尽早进入知识创新工程二期试点行列，启动了“自费改革，模拟创新”方案。

正式进入知识创新工程试点单位行列，从此开启了创新发展的新阶段。从发展目标、组织架构、人才管理和创新文化等各方面进行了新一轮的深化改革。

根据中科院“创新2020”规划，围绕国际学科前沿和国家战略需求，制定“一三五”创新发展规划。2013年顺利通过中科院组织的“一三五”国际诊断评估，进一步提升研究所国际影响力。

研究所成功进入中国科学院“特色研究所”建设首批试点研究所，进入新的历史发展时期。2018年顺利通过特色研究所建设验收。

研究所与中国林科院基于各自领域的引领优势，探索院部联合共建模式，模拟运行“森林国重”，该实验室于2024年2月5日获中国科学院批复组建，根据院党组部署要求，森林国重已全面启动建设工作。